Amazonでは色違いの商品の登録方法として「バリエーション」の機能が用意されています。
バリエーションは親子の関係で、親商品には複数の子商品をグループ化して登録することが可能です。
商品登録時は、子商品それぞれにJANコードが必要になるので、JANコードを用意しましょう。
バリエーションの設定方法はアマゾンヘルプを参考に行ってください。

アマゾンヘルプ:バリエーション登録
https://www.amazon.co.jp/gp/help/customer/display.html?nodeId=200804520