オプションで価格を設定していた場合には、「元の商品価格+オプションで設定した価格」の合計に対して、各種条件や倍率が計算されます。
yahoo!のガイドラインでも紹介されているので、詳細は下記ガイドページにてご確認ください。

https://store-info.yahoo.co.jp/s/shopping/toolmanual/editor/d/412.html